Хакасский госуниверситет сегодня –  один из ведущих классических вузов Сибири. Он был создан  на базе Абаканского государственного педагогического института и четырёх учебных заведений среднего профессионального образования. В честь 30-летия ХГУ университетское сообщество подготовило праздничные концерты, интерактивные площадки. В Научной библиотеке ХГУ также организована книжная выставка, на которой можно  ознакомиться с историей жизни вуза.

Приказом Госкомвуза России первым ректором Хакасского государственного университета назначили Валентина Кузьмина, который был опытным администратором и организатором, и его не пугали нововведения и жесткая конкуренция в сфере образования. Он умел рисковать и добиваться результатов. В 1994-1995 учебном году был произведен первый набор в Хакасский государственный университет. В 1995-1996 учебном году состоялся первый выпуск студентов, в дипломах которых было записано, что они окончили Хакасский государственный университет.

В первое десятилетие жизнедеятельности университета были открыты новые специальности и направления подготовки специалистов. В 1997-1998 годах в университете началось укрупнение структурных подразделений с целью унификации управления и оптимизации учебного процесса и научно-исследовательской деятельности. Новой учебной структурной единицей стал институт.

В 2002 году структура университета расширилась за счет открытия медико-психолого-социального института . Интенсивное развитие в университете гуманитарных дисциплин позволило открыть в 2003 году Объединенный диссертационный совет по защите диссертаций на соискание учёной степени кандидата исторических наук, первый и единственный на территории национальных регионов Южной Сибири. В 2009 году был создан сельскохозяйственный институт на базе факультета ветеринарной медицины, аграрного факультета и сельскохозяйственного колледжа.

С ноября 2006 года университетом руководил кандидат физико-математических наук, профессор Геннадий Сурвилло. В августе 2009 года приказом Минобрнауки РФ исполняющей обязанности ректора была назначена доктор медицинских наук Ольга Штыгашева. В январе 2010 года ей избрали ректором.

В 2015 году на должность ректора ХГУ была избрана доктор экономических наук, профессор Татьяна Краснова.

Сегодня в составе университета – 7 институтов, 4 колледжа,  научно-исследовательский институт, учебно-научные центры, музеи, библиотека, лаборатории, издательство. Университет располагает развитой материально-технической базой, позволяющей решать на современном уровне вопросы обучения и воспитания студентов. Общее число обучающихся – более 9 тысяч.

На основе долгосрочных договоров университет успешно сотрудничает с  зарубежными вузами и международными организациями из 5 стран мира (Монголия, Казахстан, Узбекистан, Кыргызстан, Беларусь). Для иностранных граждан реализуется программа дополнительного образования по изучению русского языка. Ежегодно проводятся международные конференции.

Формирование университета как центра развития образования, науки и культуры определило стратегию его деятельности, направления которой конкретизированы в Концепции развития Хакасского государственного университета им. Н. Ф. Катанова и первой Программе его развития в 1995-2000 годах. Она предусматривала введение принципа «образовательная потребность – образовательная услуга» взамен прежнего «заказ – подготовка», гибкость и вариативность программ, расширение научной функции вуза.

Хакасский госуниверситет –  единственный вуз в России, который ведёт подготовку специалистов в области хакасского языка и литературы, народного творчества. В этом направлении ведущим научно-исследовательским подразделением университета является институт гуманитарных исследований и саяно-алтайской тюркологии.

Выпускники университета, среди которых учёные, педагоги, государственные деятели, специалисты и руководители ведомств, учреждений и предприятий, достойно представляют свой вуз во всех сферах профессиональной деятельности.